Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TROQ12816 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
TROQ12816 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
TROQ12816 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
TROQ12816 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TROQ12816 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TROQ12816 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
TROQ12816 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TROQ12816 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TROQ12816 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TROQ12816 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TROQ12816 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TROQ12816 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TROQ12816 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
TROQ12816 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
TROQ12816 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TROQ12816 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
TROQ12816 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
TROQ12816 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TROQ12816 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TROQ12816 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
TROQ12816 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
TROQ12816 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
TROQ12816 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
TROQ12816 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TROQ12816 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TROQ12816 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
TROQ12816 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
TROQ12816 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
TROQ12816 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
TROQ12816 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TROQ12816 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TROQ12816 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TROQ12816 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TROQ12816 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC40.09■■■■■ 4.01
TROQ12816 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TROQ12816 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TROQ12816 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TROQ12816 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
TROQ12816 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
TROQ12816 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.07■■■■■ 4
TROQ12816 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
TROQ12816 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
TROQ12816 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.07■■■■■ 4
TROQ12816 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.06■■■■■ 4
TROQ12816 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TROQ12816 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
TROQ12816 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
TROQ12816 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
TROQ12816 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
TROQ12816 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
TROQ12816 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
TROQ12816 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TROQ12816 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
TROQ12816 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
TROQ12816 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TROQ12816 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
TROQ12816 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TROQ12816 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
TROQ12816 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TROQ12816 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TROQ12816 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
TROQ12816 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TROQ12816 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TROQ12816 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TROQ12816 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TROQ12816 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TROQ12816 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TROQ12816 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TROQ12816 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TROQ12816 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TROQ12816 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TROQ12816 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
TROQ12816 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
TROQ12816 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TROQ12816 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TROQ12816 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TROQ12816 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TROQ12816 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC39.88■■■■□ 3.97
TROQ12816 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TROQ12816 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TROQ12816 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TROQ12816 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TROQ12816 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TROQ12816 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TROQ12816 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TROQ12816 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TROQ12816 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TROQ12816 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
TROQ12816 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TROQ12816 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TROQ12816 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TROQ12816 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TROQ12816 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
TROQ12816 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
TROQ12816 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
TROQ12816 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
TROQ12816 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
TROQ12816 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TROQ12816 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms