Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FAAP100Q0VG06 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FAAP100Q0VG06 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAAP100Q0VG06 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAAP100Q0VG06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAAP100Q0VG06 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms