Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMOD3Q0VAK6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
LMOD3Q0VAK6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LMOD3Q0VAK6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMOD3Q0VAK6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMOD3Q0VAK6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD3Q0VAK6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms