Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PUDPQ08623 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PUDPQ08623 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PUDPQ08623 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PUDPQ08623 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms