Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
GOLGA3Q08378 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
GOLGA3Q08378 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
GOLGA3Q08378 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
GOLGA3Q08378 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.25■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
GOLGA3Q08378 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
GOLGA3Q08378 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.11■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.1■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
GOLGA3Q08378 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
GOLGA3Q08378 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
GOLGA3Q08378 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
GOLGA3Q08378 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC42.04■■■■■ 4.32
GOLGA3Q08378 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
GOLGA3Q08378 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
GOLGA3Q08378 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.02■■■■■ 4.32
GOLGA3Q08378 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC41.98■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.98■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.97■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
GOLGA3Q08378 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
GOLGA3Q08378 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
GOLGA3Q08378 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
GOLGA3Q08378 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms