Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RING1Q06587 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RING1Q06587 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RING1Q06587 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RING1Q06587 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RING1Q06587 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RING1Q06587 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RING1Q06587 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RING1Q06587 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RING1Q06587 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RING1Q06587 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RING1Q06587 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RING1Q06587 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RING1Q06587 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RING1Q06587 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RING1Q06587 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RING1Q06587 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RING1Q06587 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RING1Q06587 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RING1Q06587 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RING1Q06587 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RING1Q06587 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RING1Q06587 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RING1Q06587 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RING1Q06587 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RING1Q06587 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RING1Q06587 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RING1Q06587 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RING1Q06587 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RING1Q06587 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RING1Q06587 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RING1Q06587 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RING1Q06587 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RING1Q06587 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RING1Q06587 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RING1Q06587 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RING1Q06587 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RING1Q06587 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RING1Q06587 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RING1Q06587 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RING1Q06587 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RING1Q06587 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RING1Q06587 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RING1Q06587 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RING1Q06587 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RING1Q06587 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RING1Q06587 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RING1Q06587 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RING1Q06587 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RING1Q06587 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RING1Q06587 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RING1Q06587 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RING1Q06587 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RING1Q06587 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RING1Q06587 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RING1Q06587 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RING1Q06587 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RING1Q06587 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RING1Q06587 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RING1Q06587 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RING1Q06587 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RING1Q06587 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RING1Q06587 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RING1Q06587 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RING1Q06587 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RING1Q06587 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RING1Q06587 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RING1Q06587 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RING1Q06587 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RING1Q06587 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RING1Q06587 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RING1Q06587 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RING1Q06587 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RING1Q06587 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RING1Q06587 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RING1Q06587 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RING1Q06587 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RING1Q06587 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RING1Q06587 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RING1Q06587 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RING1Q06587 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RING1Q06587 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RING1Q06587 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RING1Q06587 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RING1Q06587 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RING1Q06587 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RING1Q06587 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RING1Q06587 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RING1Q06587 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RING1Q06587 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RING1Q06587 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RING1Q06587 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RING1Q06587 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RING1Q06587 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RING1Q06587 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RING1Q06587 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RING1Q06587 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RING1Q06587 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RING1Q06587 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RING1Q06587 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms