Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX1T1Q06455 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RUNX1T1Q06455 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RUNX1T1Q06455 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RUNX1T1Q06455 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms