Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TAP1Q03518 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TAP1Q03518 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TAP1Q03518 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TAP1Q03518 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TAP1Q03518 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TAP1Q03518 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms