Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
XPCQ01831 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
XPCQ01831 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
XPCQ01831 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
XPCQ01831 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
XPCQ01831 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
XPCQ01831 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
XPCQ01831 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
XPCQ01831 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
XPCQ01831 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
XPCQ01831 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
XPCQ01831 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
XPCQ01831 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
XPCQ01831 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
XPCQ01831 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
XPCQ01831 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
XPCQ01831 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
XPCQ01831 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
XPCQ01831 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
XPCQ01831 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
XPCQ01831 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
XPCQ01831 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
XPCQ01831 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
XPCQ01831 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
XPCQ01831 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
XPCQ01831 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
XPCQ01831 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
XPCQ01831 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
XPCQ01831 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
XPCQ01831 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
XPCQ01831 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
XPCQ01831 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
XPCQ01831 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
XPCQ01831 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
XPCQ01831 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
XPCQ01831 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
XPCQ01831 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
XPCQ01831 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
XPCQ01831 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
XPCQ01831 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
XPCQ01831 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
XPCQ01831 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
XPCQ01831 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
XPCQ01831 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
XPCQ01831 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
XPCQ01831 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
XPCQ01831 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
XPCQ01831 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
XPCQ01831 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
XPCQ01831 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
XPCQ01831 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
XPCQ01831 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
XPCQ01831 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
XPCQ01831 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
XPCQ01831 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
XPCQ01831 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
XPCQ01831 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
XPCQ01831 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
XPCQ01831 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
XPCQ01831 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
XPCQ01831 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
XPCQ01831 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
XPCQ01831 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
XPCQ01831 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
XPCQ01831 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
XPCQ01831 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
XPCQ01831 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
XPCQ01831 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
XPCQ01831 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
XPCQ01831 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
XPCQ01831 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
XPCQ01831 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
XPCQ01831 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
XPCQ01831 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
XPCQ01831 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
XPCQ01831 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
XPCQ01831 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
XPCQ01831 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
XPCQ01831 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
XPCQ01831 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
XPCQ01831 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
XPCQ01831 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
XPCQ01831 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
XPCQ01831 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
XPCQ01831 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
XPCQ01831 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
XPCQ01831 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
XPCQ01831 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
XPCQ01831 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
XPCQ01831 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
XPCQ01831 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
XPCQ01831 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
XPCQ01831 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
XPCQ01831 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
XPCQ01831 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
XPCQ01831 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
XPCQ01831 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
XPCQ01831 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
XPCQ01831 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
XPCQ01831 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms