Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EXOSC10Q01780 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EXOSC10Q01780 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
EXOSC10Q01780 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EXOSC10Q01780 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EXOSC10Q01780 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
EXOSC10Q01780 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
EXOSC10Q01780 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EXOSC10Q01780 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EXOSC10Q01780 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EXOSC10Q01780 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EXOSC10Q01780 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms