Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MS4A2Q01362 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MS4A2Q01362 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MS4A2Q01362 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MS4A2Q01362 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MS4A2Q01362 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms