Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD83Q01151 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD83Q01151 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD83Q01151 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD83Q01151 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD83Q01151 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD83Q01151 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD83Q01151 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD83Q01151 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD83Q01151 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD83Q01151 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD83Q01151 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD83Q01151 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD83Q01151 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD83Q01151 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD83Q01151 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD83Q01151 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD83Q01151 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD83Q01151 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD83Q01151 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD83Q01151 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD83Q01151 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD83Q01151 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD83Q01151 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD83Q01151 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD83Q01151 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD83Q01151 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD83Q01151 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD83Q01151 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD83Q01151 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD83Q01151 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD83Q01151 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD83Q01151 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD83Q01151 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD83Q01151 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD83Q01151 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD83Q01151 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD83Q01151 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD83Q01151 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD83Q01151 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD83Q01151 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD83Q01151 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD83Q01151 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD83Q01151 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD83Q01151 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD83Q01151 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD83Q01151 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD83Q01151 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD83Q01151 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD83Q01151 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD83Q01151 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD83Q01151 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD83Q01151 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD83Q01151 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD83Q01151 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD83Q01151 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD83Q01151 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD83Q01151 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD83Q01151 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CD83Q01151 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD83Q01151 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD83Q01151 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD83Q01151 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD83Q01151 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD83Q01151 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CD83Q01151 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD83Q01151 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD83Q01151 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CD83Q01151 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD83Q01151 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD83Q01151 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD83Q01151 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD83Q01151 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD83Q01151 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD83Q01151 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD83Q01151 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD83Q01151 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CD83Q01151 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD83Q01151 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD83Q01151 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD83Q01151 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD83Q01151 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD83Q01151 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms