Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MYBPC1Q00872 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MYBPC1Q00872 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MYBPC1Q00872 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYBPC1Q00872 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYBPC1Q00872 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms