Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDKL1Q00532 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDKL1Q00532 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDKL1Q00532 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDKL1Q00532 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms