Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX1P83916 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX1P83916 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX1P83916 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX1P83916 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX1P83916 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX1P83916 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX1P83916 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CBX1P83916 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBX1P83916 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CBX1P83916 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CBX1P83916 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX1P83916 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX1P83916 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX1P83916 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CBX1P83916 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBX1P83916 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBX1P83916 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CBX1P83916 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX1P83916 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX1P83916 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX1P83916 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX1P83916 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX1P83916 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX1P83916 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBX1P83916 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX1P83916 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX1P83916 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX1P83916 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CBX1P83916 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CBX1P83916 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CBX1P83916 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CBX1P83916 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CBX1P83916 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX1P83916 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX1P83916 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX1P83916 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX1P83916 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CBX1P83916 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBX1P83916 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX1P83916 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX1P83916 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBX1P83916 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBX1P83916 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CBX1P83916 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CBX1P83916 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBX1P83916 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX1P83916 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX1P83916 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX1P83916 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CBX1P83916 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX1P83916 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX1P83916 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX1P83916 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX1P83916 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX1P83916 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CBX1P83916 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX1P83916 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX1P83916 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX1P83916 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX1P83916 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBX1P83916 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBX1P83916 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CBX1P83916 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CBX1P83916 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CBX1P83916 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX1P83916 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX1P83916 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBX1P83916 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBX1P83916 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBX1P83916 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CBX1P83916 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBX1P83916 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX1P83916 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX1P83916 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CBX1P83916 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBX1P83916 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBX1P83916 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBX1P83916 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBX1P83916 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBX1P83916 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CBX1P83916 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBX1P83916 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBX1P83916 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CBX1P83916 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX1P83916 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX1P83916 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX1P83916 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX1P83916 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX1P83916 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CBX1P83916 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBX1P83916 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CBX1P83916 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX1P83916 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX1P83916 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CBX1P83916 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX1P83916 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX1P83916 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX1P83916 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBX1P83916 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms