Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFI35P80217 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFI35P80217 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IFI35P80217 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IFI35P80217 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IFI35P80217 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFI35P80217 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFI35P80217 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFI35P80217 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFI35P80217 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFI35P80217 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFI35P80217 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFI35P80217 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFI35P80217 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFI35P80217 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFI35P80217 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IFI35P80217 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFI35P80217 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFI35P80217 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IFI35P80217 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFI35P80217 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFI35P80217 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFI35P80217 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFI35P80217 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFI35P80217 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFI35P80217 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFI35P80217 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFI35P80217 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFI35P80217 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFI35P80217 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFI35P80217 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFI35P80217 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFI35P80217 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFI35P80217 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFI35P80217 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFI35P80217 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFI35P80217 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFI35P80217 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFI35P80217 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFI35P80217 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFI35P80217 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFI35P80217 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFI35P80217 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFI35P80217 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFI35P80217 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFI35P80217 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFI35P80217 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFI35P80217 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFI35P80217 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFI35P80217 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFI35P80217 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFI35P80217 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFI35P80217 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IFI35P80217 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFI35P80217 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFI35P80217 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFI35P80217 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFI35P80217 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
IFI35P80217 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFI35P80217 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFI35P80217 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFI35P80217 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFI35P80217 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFI35P80217 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IFI35P80217 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFI35P80217 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFI35P80217 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFI35P80217 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFI35P80217 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IFI35P80217 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFI35P80217 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFI35P80217 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFI35P80217 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFI35P80217 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
IFI35P80217 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFI35P80217 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFI35P80217 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFI35P80217 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IFI35P80217 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFI35P80217 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFI35P80217 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFI35P80217 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFI35P80217 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFI35P80217 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFI35P80217 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFI35P80217 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IFI35P80217 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFI35P80217 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IFI35P80217 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFI35P80217 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFI35P80217 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFI35P80217 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFI35P80217 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IFI35P80217 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFI35P80217 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFI35P80217 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFI35P80217 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFI35P80217 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFI35P80217 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFI35P80217 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms