Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
IRX6P78412 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IRX6P78412 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IRX6P78412 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
IRX6P78412 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
IRX6P78412 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IRX6P78412 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IRX6P78412 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IRX6P78412 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
IRX6P78412 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
IRX6P78412 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
IRX6P78412 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
IRX6P78412 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
IRX6P78412 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
IRX6P78412 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
IRX6P78412 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
IRX6P78412 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
IRX6P78412 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
IRX6P78412 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
IRX6P78412 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
IRX6P78412 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
IRX6P78412 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
IRX6P78412 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
IRX6P78412 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
IRX6P78412 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
IRX6P78412 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
IRX6P78412 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
IRX6P78412 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
IRX6P78412 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IRX6P78412 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IRX6P78412 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
IRX6P78412 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
IRX6P78412 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
IRX6P78412 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
IRX6P78412 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
IRX6P78412 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
IRX6P78412 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
IRX6P78412 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
IRX6P78412 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
IRX6P78412 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
IRX6P78412 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
IRX6P78412 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
IRX6P78412 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IRX6P78412 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
IRX6P78412 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
IRX6P78412 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
IRX6P78412 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
IRX6P78412 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
IRX6P78412 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
IRX6P78412 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
IRX6P78412 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
IRX6P78412 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IRX6P78412 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
IRX6P78412 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IRX6P78412 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
IRX6P78412 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
IRX6P78412 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
IRX6P78412 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
IRX6P78412 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
IRX6P78412 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
IRX6P78412 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
IRX6P78412 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
IRX6P78412 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
IRX6P78412 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
IRX6P78412 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
IRX6P78412 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
IRX6P78412 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
IRX6P78412 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
IRX6P78412 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
IRX6P78412 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
IRX6P78412 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IRX6P78412 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IRX6P78412 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IRX6P78412 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IRX6P78412 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
IRX6P78412 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
IRX6P78412 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
IRX6P78412 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
IRX6P78412 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IRX6P78412 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
IRX6P78412 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
IRX6P78412 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
IRX6P78412 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
IRX6P78412 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
IRX6P78412 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
IRX6P78412 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
IRX6P78412 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
IRX6P78412 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
IRX6P78412 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
IRX6P78412 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
IRX6P78412 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
IRX6P78412 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
IRX6P78412 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
IRX6P78412 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
IRX6P78412 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
IRX6P78412 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
IRX6P78412 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IRX6P78412 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
IRX6P78412 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
IRX6P78412 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms