Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEP78395 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEP78395 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEP78395 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEP78395 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms