Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAM193AP78312 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
FAM193AP78312 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM193AP78312 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM193AP78312 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms