Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RACK1P63244 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RACK1P63244 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RACK1P63244 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RACK1P63244 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RACK1P63244 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RACK1P63244 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RACK1P63244 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RACK1P63244 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RACK1P63244 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RACK1P63244 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RACK1P63244 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RACK1P63244 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RACK1P63244 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RACK1P63244 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RACK1P63244 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RACK1P63244 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RACK1P63244 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RACK1P63244 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RACK1P63244 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RACK1P63244 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RACK1P63244 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RACK1P63244 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RACK1P63244 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RACK1P63244 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RACK1P63244 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RACK1P63244 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RACK1P63244 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RACK1P63244 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RACK1P63244 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RACK1P63244 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RACK1P63244 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RACK1P63244 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RACK1P63244 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RACK1P63244 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RACK1P63244 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RACK1P63244 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RACK1P63244 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RACK1P63244 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RACK1P63244 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RACK1P63244 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RACK1P63244 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RACK1P63244 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RACK1P63244 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RACK1P63244 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RACK1P63244 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RACK1P63244 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RACK1P63244 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RACK1P63244 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RACK1P63244 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RACK1P63244 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RACK1P63244 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RACK1P63244 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RACK1P63244 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RACK1P63244 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RACK1P63244 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RACK1P63244 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RACK1P63244 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RACK1P63244 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RACK1P63244 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RACK1P63244 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RACK1P63244 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RACK1P63244 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RACK1P63244 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RACK1P63244 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RACK1P63244 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RACK1P63244 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RACK1P63244 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RACK1P63244 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RACK1P63244 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RACK1P63244 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RACK1P63244 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RACK1P63244 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RACK1P63244 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RACK1P63244 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RACK1P63244 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RACK1P63244 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RACK1P63244 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RACK1P63244 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RACK1P63244 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RACK1P63244 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RACK1P63244 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RACK1P63244 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RACK1P63244 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RACK1P63244 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RACK1P63244 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RACK1P63244 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RACK1P63244 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RACK1P63244 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RACK1P63244 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RACK1P63244 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RACK1P63244 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RACK1P63244 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RACK1P63244 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RACK1P63244 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RACK1P63244 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RACK1P63244 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RACK1P63244 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RACK1P63244 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RACK1P63244 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms