Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL23AP62750 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RPL23AP62750 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPL23AP62750 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPL23AP62750 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms