Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HERVK_113P62684 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HERVK_113P62684 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HERVK_113P62684 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HERVK_113P62684 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HERVK_113P62684 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HERVK_113P62684 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HERVK_113P62684 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HERVK_113P62684 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 424.7 ms