Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBE2MP61081 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBE2MP61081 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
UBE2MP61081 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2MP61081 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2MP61081 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2MP61081 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2MP61081 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2MP61081 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2MP61081 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms