Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FBXW4P57775 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FBXW4P57775 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXW4P57775 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXW4P57775 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.2 ms