Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTBP2P56545 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTBP2P56545 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTBP2P56545 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTBP2P56545 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTBP2P56545 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms