Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTTPP55157 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTTPP55157 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTTPP55157 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTTPP55157 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTTPP55157 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTTPP55157 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTTPP55157 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTTPP55157 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTTPP55157 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTTPP55157 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MTTPP55157 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTTPP55157 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTTPP55157 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTTPP55157 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTTPP55157 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTTPP55157 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTTPP55157 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTTPP55157 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTTPP55157 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTTPP55157 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTTPP55157 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTTPP55157 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTTPP55157 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTTPP55157 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTTPP55157 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTTPP55157 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTTPP55157 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTTPP55157 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTTPP55157 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTTPP55157 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTTPP55157 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTTPP55157 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTTPP55157 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTTPP55157 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTTPP55157 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTTPP55157 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTTPP55157 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTTPP55157 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTTPP55157 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTTPP55157 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTTPP55157 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTTPP55157 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTTPP55157 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTTPP55157 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTTPP55157 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTTPP55157 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MTTPP55157 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTTPP55157 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTTPP55157 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTTPP55157 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTTPP55157 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTTPP55157 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTTPP55157 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTTPP55157 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTTPP55157 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTTPP55157 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTTPP55157 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTTPP55157 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTTPP55157 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTTPP55157 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTTPP55157 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTTPP55157 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTTPP55157 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTTPP55157 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTTPP55157 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTTPP55157 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTTPP55157 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTTPP55157 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTTPP55157 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTTPP55157 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTTPP55157 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTTPP55157 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTTPP55157 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTTPP55157 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTTPP55157 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTTPP55157 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTTPP55157 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTTPP55157 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTTPP55157 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTTPP55157 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTTPP55157 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTTPP55157 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTTPP55157 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTTPP55157 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTTPP55157 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTTPP55157 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTTPP55157 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTTPP55157 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTTPP55157 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTTPP55157 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTTPP55157 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTTPP55157 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTTPP55157 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTTPP55157 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTTPP55157 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTTPP55157 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTTPP55157 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTTPP55157 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTTPP55157 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms