Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP12AP54707 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATP12AP54707 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP12AP54707 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP12AP54707 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms