Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LIMK1P53667 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIMK1P53667 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIMK1P53667 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LIMK1P53667 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LIMK1P53667 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms