Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DAP3P51398 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DAP3P51398 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DAP3P51398 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DAP3P51398 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DAP3P51398 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DAP3P51398 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DAP3P51398 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DAP3P51398 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DAP3P51398 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DAP3P51398 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DAP3P51398 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DAP3P51398 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DAP3P51398 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DAP3P51398 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DAP3P51398 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DAP3P51398 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DAP3P51398 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DAP3P51398 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DAP3P51398 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DAP3P51398 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DAP3P51398 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DAP3P51398 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DAP3P51398 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DAP3P51398 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DAP3P51398 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DAP3P51398 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DAP3P51398 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DAP3P51398 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DAP3P51398 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DAP3P51398 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DAP3P51398 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DAP3P51398 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DAP3P51398 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DAP3P51398 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DAP3P51398 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DAP3P51398 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DAP3P51398 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DAP3P51398 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DAP3P51398 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DAP3P51398 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DAP3P51398 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DAP3P51398 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DAP3P51398 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DAP3P51398 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DAP3P51398 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DAP3P51398 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DAP3P51398 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DAP3P51398 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DAP3P51398 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DAP3P51398 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DAP3P51398 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DAP3P51398 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DAP3P51398 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DAP3P51398 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DAP3P51398 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DAP3P51398 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DAP3P51398 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DAP3P51398 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DAP3P51398 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DAP3P51398 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DAP3P51398 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DAP3P51398 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DAP3P51398 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DAP3P51398 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DAP3P51398 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DAP3P51398 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DAP3P51398 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DAP3P51398 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DAP3P51398 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DAP3P51398 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DAP3P51398 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DAP3P51398 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DAP3P51398 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DAP3P51398 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DAP3P51398 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DAP3P51398 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DAP3P51398 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DAP3P51398 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DAP3P51398 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DAP3P51398 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DAP3P51398 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DAP3P51398 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DAP3P51398 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DAP3P51398 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DAP3P51398 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DAP3P51398 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DAP3P51398 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DAP3P51398 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DAP3P51398 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DAP3P51398 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DAP3P51398 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DAP3P51398 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DAP3P51398 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DAP3P51398 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DAP3P51398 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DAP3P51398 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DAP3P51398 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DAP3P51398 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DAP3P51398 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms