Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD97P48960 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD97P48960 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD97P48960 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD97P48960 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD97P48960 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD97P48960 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD97P48960 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD97P48960 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD97P48960 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD97P48960 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD97P48960 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD97P48960 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD97P48960 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CD97P48960 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD97P48960 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD97P48960 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD97P48960 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD97P48960 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD97P48960 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD97P48960 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD97P48960 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD97P48960 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD97P48960 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD97P48960 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD97P48960 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD97P48960 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD97P48960 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD97P48960 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD97P48960 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD97P48960 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD97P48960 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CD97P48960 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD97P48960 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD97P48960 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD97P48960 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD97P48960 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD97P48960 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD97P48960 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD97P48960 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD97P48960 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD97P48960 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD97P48960 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD97P48960 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD97P48960 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD97P48960 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD97P48960 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD97P48960 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD97P48960 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD97P48960 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD97P48960 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD97P48960 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD97P48960 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD97P48960 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD97P48960 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD97P48960 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD97P48960 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CD97P48960 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD97P48960 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD97P48960 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD97P48960 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD97P48960 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD97P48960 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD97P48960 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD97P48960 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD97P48960 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD97P48960 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD97P48960 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD97P48960 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD97P48960 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD97P48960 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD97P48960 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD97P48960 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD97P48960 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD97P48960 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CD97P48960 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD97P48960 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD97P48960 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD97P48960 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD97P48960 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms