Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC9A3P48764 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9A3P48764 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9A3P48764 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A3P48764 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms