Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX2P48378 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX2P48378 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX2P48378 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX2P48378 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX2P48378 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX2P48378 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX2P48378 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX2P48378 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX2P48378 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX2P48378 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX2P48378 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX2P48378 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX2P48378 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX2P48378 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX2P48378 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX2P48378 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RFX2P48378 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX2P48378 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX2P48378 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX2P48378 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX2P48378 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX2P48378 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX2P48378 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX2P48378 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX2P48378 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX2P48378 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX2P48378 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX2P48378 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX2P48378 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX2P48378 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX2P48378 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX2P48378 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX2P48378 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX2P48378 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX2P48378 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX2P48378 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX2P48378 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX2P48378 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX2P48378 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX2P48378 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX2P48378 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX2P48378 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX2P48378 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX2P48378 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX2P48378 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX2P48378 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX2P48378 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFX2P48378 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX2P48378 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX2P48378 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX2P48378 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX2P48378 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX2P48378 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFX2P48378 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX2P48378 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX2P48378 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX2P48378 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX2P48378 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX2P48378 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFX2P48378 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX2P48378 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX2P48378 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX2P48378 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX2P48378 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX2P48378 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX2P48378 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX2P48378 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX2P48378 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX2P48378 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX2P48378 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX2P48378 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX2P48378 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX2P48378 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX2P48378 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX2P48378 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX2P48378 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX2P48378 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX2P48378 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX2P48378 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX2P48378 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX2P48378 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX2P48378 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms