Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC6A9P48067 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC6A9P48067 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC6A9P48067 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A9P48067 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms