Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIA4P48058 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIA4P48058 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIA4P48058 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRIA4P48058 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRIA4P48058 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms