Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GNPDA1P46926 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GNPDA1P46926 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GNPDA1P46926 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GNPDA1P46926 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GNPDA1P46926 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms