Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC1A1P43005 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC1A1P43005 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC1A1P43005 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC1A1P43005 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC1A1P43005 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms