Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC1A3P43003 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC1A3P43003 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC1A3P43003 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A3P43003 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms