Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HADHAP40939 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHAP40939 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HADHAP40939 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHAP40939 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HADHAP40939 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HADHAP40939 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HADHAP40939 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HADHAP40939 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHAP40939 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HADHAP40939 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHAP40939 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHAP40939 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HADHAP40939 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHAP40939 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHAP40939 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHAP40939 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHAP40939 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHAP40939 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HADHAP40939 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHAP40939 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHAP40939 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHAP40939 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HADHAP40939 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HADHAP40939 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HADHAP40939 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HADHAP40939 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HADHAP40939 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HADHAP40939 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HADHAP40939 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHAP40939 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHAP40939 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHAP40939 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHAP40939 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHAP40939 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HADHAP40939 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HADHAP40939 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HADHAP40939 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHAP40939 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHAP40939 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHAP40939 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHAP40939 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHAP40939 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHAP40939 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HADHAP40939 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHAP40939 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHAP40939 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HADHAP40939 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HADHAP40939 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HADHAP40939 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HADHAP40939 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HADHAP40939 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HADHAP40939 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HADHAP40939 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HADHAP40939 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HADHAP40939 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HADHAP40939 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHAP40939 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHAP40939 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHAP40939 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHAP40939 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHAP40939 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHAP40939 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHAP40939 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HADHAP40939 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHAP40939 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHAP40939 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHAP40939 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHAP40939 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHAP40939 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHAP40939 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HADHAP40939 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHAP40939 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHAP40939 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHAP40939 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHAP40939 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHAP40939 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHAP40939 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHAP40939 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HADHAP40939 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HADHAP40939 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HADHAP40939 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HADHAP40939 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HADHAP40939 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHAP40939 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHAP40939 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHAP40939 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHAP40939 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHAP40939 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHAP40939 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHAP40939 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms