Protein–RNA interactions for Protein: P37173

TGFBR2, TGF-beta receptor type-2, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR2P37173 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TGFBR2P37173 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TGFBR2P37173 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TGFBR2P37173 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TGFBR2P37173 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TGFBR2P37173 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms