Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SREBF1P36956 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SREBF1P36956 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SREBF1P36956 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SREBF1P36956 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SREBF1P36956 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SREBF1P36956 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms