Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGER4P35408 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGER4P35408 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGER4P35408 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGER4P35408 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGER4P35408 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms