Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTNNB1P35222 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNNB1P35222 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNB1P35222 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNB1P35222 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNB1P35222 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNB1P35222 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNB1P35222 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTNNB1P35222 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNB1P35222 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNB1P35222 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CTNNB1P35222 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNB1P35222 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTNNB1P35222 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNB1P35222 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNB1P35222 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNB1P35222 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNB1P35222 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNB1P35222 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNB1P35222 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CTNNB1P35222 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNB1P35222 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms