Protein–RNA interactions for Protein: P33261

CYP2C19, Cytochrome P450 2C19, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C19P33261 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYP2C19P33261 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYP2C19P33261 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYP2C19P33261 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CYP2C19P33261 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CYP2C19P33261 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CYP2C19P33261 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYP2C19P33261 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CYP2C19P33261 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYP2C19P33261 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms