Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCND3P30281 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCND3P30281 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCND3P30281 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCND3P30281 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCND3P30281 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCND3P30281 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCND3P30281 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCND3P30281 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCND3P30281 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCND3P30281 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCND3P30281 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCND3P30281 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCND3P30281 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCND3P30281 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCND3P30281 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCND3P30281 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCND3P30281 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCND3P30281 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCND3P30281 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCND3P30281 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCND3P30281 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND3P30281 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND3P30281 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND3P30281 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND3P30281 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND3P30281 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCND3P30281 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCND3P30281 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCND3P30281 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCND3P30281 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCND3P30281 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CCND3P30281 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCND3P30281 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCND3P30281 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCND3P30281 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCND3P30281 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CCND3P30281 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCND3P30281 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCND3P30281 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCND3P30281 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCND3P30281 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCND3P30281 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CCND3P30281 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CCND3P30281 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCND3P30281 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND3P30281 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND3P30281 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND3P30281 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND3P30281 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCND3P30281 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCND3P30281 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND3P30281 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND3P30281 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CCND3P30281 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCND3P30281 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCND3P30281 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCND3P30281 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CCND3P30281 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCND3P30281 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND3P30281 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND3P30281 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND3P30281 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND3P30281 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND3P30281 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCND3P30281 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND3P30281 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND3P30281 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND3P30281 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND3P30281 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND3P30281 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND3P30281 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCND3P30281 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCND3P30281 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCND3P30281 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCND3P30281 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCND3P30281 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCND3P30281 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCND3P30281 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCND3P30281 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCND3P30281 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCND3P30281 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCND3P30281 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCND3P30281 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCND3P30281 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CCND3P30281 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCND3P30281 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCND3P30281 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CCND3P30281 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCND3P30281 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCND3P30281 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCND3P30281 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND3P30281 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND3P30281 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND3P30281 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND3P30281 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND3P30281 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND3P30281 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND3P30281 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCND3P30281 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms