Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CDC27P30260 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CDC27P30260 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CDC27P30260 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CDC27P30260 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CDC27P30260 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
CDC27P30260 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDC27P30260 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDC27P30260 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDC27P30260 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDC27P30260 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDC27P30260 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDC27P30260 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDC27P30260 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CDC27P30260 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDC27P30260 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDC27P30260 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDC27P30260 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDC27P30260 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDC27P30260 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDC27P30260 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CDC27P30260 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDC27P30260 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CDC27P30260 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDC27P30260 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDC27P30260 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDC27P30260 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDC27P30260 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDC27P30260 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDC27P30260 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDC27P30260 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDC27P30260 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDC27P30260 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDC27P30260 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDC27P30260 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDC27P30260 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDC27P30260 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDC27P30260 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDC27P30260 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDC27P30260 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDC27P30260 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDC27P30260 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CDC27P30260 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDC27P30260 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDC27P30260 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDC27P30260 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDC27P30260 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDC27P30260 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDC27P30260 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CDC27P30260 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDC27P30260 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDC27P30260 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDC27P30260 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDC27P30260 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDC27P30260 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDC27P30260 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDC27P30260 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDC27P30260 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDC27P30260 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDC27P30260 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDC27P30260 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDC27P30260 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDC27P30260 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDC27P30260 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDC27P30260 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CDC27P30260 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CDC27P30260 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDC27P30260 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDC27P30260 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDC27P30260 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDC27P30260 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDC27P30260 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDC27P30260 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CDC27P30260 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDC27P30260 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDC27P30260 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDC27P30260 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDC27P30260 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CDC27P30260 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDC27P30260 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDC27P30260 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDC27P30260 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDC27P30260 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDC27P30260 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDC27P30260 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDC27P30260 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDC27P30260 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDC27P30260 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDC27P30260 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDC27P30260 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDC27P30260 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CDC27P30260 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDC27P30260 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDC27P30260 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CDC27P30260 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDC27P30260 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDC27P30260 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDC27P30260 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CDC27P30260 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDC27P30260 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms