Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD40LGP29965 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD40LGP29965 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CD40LGP29965 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD40LGP29965 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD40LGP29965 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms