Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HTR1BP28222 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HTR1BP28222 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTR1BP28222 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HTR1BP28222 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HTR1BP28222 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms