Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FGFR3P22607 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FGFR3P22607 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGFR3P22607 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGFR3P22607 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FGFR3P22607 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FGFR3P22607 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FGFR3P22607 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
FGFR3P22607 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms