Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCN1P20061 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCN1P20061 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCN1P20061 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCN1P20061 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCN1P20061 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCN1P20061 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCN1P20061 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCN1P20061 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCN1P20061 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCN1P20061 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCN1P20061 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCN1P20061 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCN1P20061 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCN1P20061 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCN1P20061 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCN1P20061 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCN1P20061 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCN1P20061 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCN1P20061 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCN1P20061 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCN1P20061 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCN1P20061 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCN1P20061 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCN1P20061 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCN1P20061 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCN1P20061 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCN1P20061 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCN1P20061 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TCN1P20061 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCN1P20061 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCN1P20061 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCN1P20061 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCN1P20061 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCN1P20061 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCN1P20061 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCN1P20061 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCN1P20061 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCN1P20061 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCN1P20061 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCN1P20061 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCN1P20061 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCN1P20061 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCN1P20061 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCN1P20061 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCN1P20061 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCN1P20061 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCN1P20061 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCN1P20061 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCN1P20061 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCN1P20061 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCN1P20061 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCN1P20061 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCN1P20061 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCN1P20061 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCN1P20061 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCN1P20061 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCN1P20061 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCN1P20061 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCN1P20061 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCN1P20061 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCN1P20061 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCN1P20061 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCN1P20061 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCN1P20061 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCN1P20061 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCN1P20061 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCN1P20061 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCN1P20061 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCN1P20061 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCN1P20061 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCN1P20061 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCN1P20061 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCN1P20061 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCN1P20061 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCN1P20061 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCN1P20061 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCN1P20061 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCN1P20061 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCN1P20061 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCN1P20061 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN1P20061 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN1P20061 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN1P20061 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN1P20061 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCN1P20061 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCN1P20061 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCN1P20061 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCN1P20061 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCN1P20061 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCN1P20061 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCN1P20061 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCN1P20061 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCN1P20061 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN1P20061 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN1P20061 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN1P20061 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN1P20061 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN1P20061 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCN1P20061 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms