Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2B1P20020 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2B1P20020 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2B1P20020 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP2B1P20020 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2B1P20020 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms